大肠杆菌 O157 基因组 DNA 序列标准物质
Escherichia coli O157 Whole Genome DNA Standard Sequence
大肠杆菌O157基因组DNA序列标准物质将应用于微生物测序准确性和微生物鉴定质量控制,同时还可用于评价不同高通量测序仪器测序结果的准确性和数据分析方法的准确性。
一、样品制备
该标准物质从 ATCC 的大肠杆菌 O157 标准菌株 EDL 931(ATCC35150)提取的基因组 DNA 进行的制备。
二、溯源性及定值方法
该标准物质的量值是微生物源大肠杆菌O157 的基因组 DNA 标准序列,采用多种高通量测序平台进行测序、序列拼接,整合成一个序列比较文件,统计每个位点在不同文件中的碱基情况,将长度大于 100bp 的测序碱基型完全一致位点组成 100%置信度的一致性序列作为标准序列,该序列长度为 1.82Mb。
三、特性量值及置信度
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名 称
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编 号
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标准序列
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置信度
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大肠杆菌O157 基因组
DNA 序列标准物质
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BW5202
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NIMM01.ecoliO157.referencesequence.fa 和
NIMM01.ecoliO157.position.bed
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100%
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四、均匀性及稳定性
参考 JJF1343-2012《标准物质定值的通用原则及统计学原理》,批量制备的微生物源大肠杆菌O157 基因组 DNA 标准序列,分装后随机抽取一定数量的样品,采用检测核酸浓度和 PFGE 检测 DNA 片段大小分布方法进行检验均匀性,结果表明标准物质的均匀性良好;并按照先密后疏的原则采用与均匀性检验相同方法进行稳定性考察研究,结果表明标准物质在 4℃和 25℃能稳定保存 4 周,-20℃可以稳定保存 6 个月。
本标准物质自定值日期起,有效期 6 个月。研制单位将继续跟踪监测该标准物质的稳定性,有效期内如发现变化,将及时通知用户。
五、包装、储存及使用
- 包装与储存:本标准物质保存在 TE 缓冲液中(10mM TRIS,pH8.0,1mM EDTA,pH8.0) 采用带有螺旋盖的冻存管包装,每瓶 4μg;置于-20℃温度下冷冻保存。
- 使用:使用时要恢复至室温(15~30)℃后使用。
六、附件
- 大肠杆菌O157 基因组DNA 高置信标准序列文件:NIMM01.ecoliO157.referencesequence.fa
- 大肠杆菌O157 基因组DNA 高置信标准序列位置信息文件:NIMM01.ecoliO157.position.bed
声明
1.本标准物质仅供实验室研究与分析测试工作使用,不能作为国家有证标准物质,开展法制计量相关工作。
2.因用户使用或储存不当所引起的投诉,不予承担责任。
3.收到后请立即核对品种、数量和包装,相关赔偿只限于标准物质本身,不涉及其他任何损失。
4.仅对加盖“中国计量科学研究院标准物质专用章”的完整证书负责。请妥善保管此证书。
5.如需获得更多与应用有关的信息,请与技术咨询部门联系。
注:以上信息仅供参考,以产品附带证书为准。